菏泽工程技师学院始建于一九九零年，是一所以技能培养为主的国办全日制技工院校，原为菏泽市牡丹区技工学校。2005年4月学校被山东省劳动保障厅批准晋升为山东省重点技工学校；2009年4月学校被国家人社部批准晋升为国家级重点技工学校；2011年12月学校被国家人社部批准晋升为高级技工学校；2012年4月学校被国家人社部、教育部、财政部批准为第三批国家中等职业教育改革发展示范校建设单位，2018年12月通过国家验收；2018年3月学校被山东省人社厅确定为“山东省技工教育特色名校”建设项目单位，全省共8所技工院校，学校名列第二；2018年7月学校被山东省人社厅批准为“山东省首批中德智能制造人才双元培养试点单位”；2018年8月山东省人民政府批复学校改建为“菏泽工程技师学院”；2018年12月学校被山东省人社厅确认为“山东省技师工作站”；2019年9月被山东省人社厅评为“山东省技工教育”先进集体。多次被菏泽市人社局、教育局评为菏泽市先进办学单位、菏泽市技工教育先进单位、菏泽市招生安置先进单位、菏泽市教学质量优秀单位、菏泽市首批高技能人才培训基地、菏泽市技师工作站、菏泽市首席技师工作站。